我们是小规模纳税人，中标工程是按9%的税率给我们的，我们开票是3%的税，一审没有扣我们的税差，二审要扣我们6个点税差，因招标文件计价是按一般计价法编制，没有将一般纳税人和小规模纳税人分开计价，我们也只有按招标文件来做报价，计税是9个点总报价，合同也是按9个点的税计取的，二审扣我们的6个点税差他们合理合法吗，求解