公司投资另一家公司并与另一个自然人一起控股，这种情况如何分配利润？会重复课税吗？

可以这么说，从税务角度来看，公司投资另一家公司的利润类型分为股息收益和股权收益两种。股息收益指的是投资者通过投资获得的利润，会按照企业所得税法规定交纳企业所得税，此外还应额外支付15%的高税率；股权收益指的是投资者通过股权投资获得的利润，会按照境内个人所得税法规定交纳个人所得税，此外还应额外支付20%的高税率，因此投资者应根据实际情况按照不同税率交纳税款，避免重复课税。